CIG NEWS Archive

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May 1, 2017 BIG Sem. P. Martin

BIG seminars 2016-2017 (Download poster)

Every first Monday of the month
16h15, Auditorium Biophore Building
UniL-Sorge at Dorigny
 
 
BIG is an interdepartmental seminar series, and is organized by Vincent Dion, Ted Farmer, Thomas Flatt and Sophie Martin
 
1 May 2017  Paul Martin, University of Bristol
“Live imaging of inflammation in repair and cancer”
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Mon May 8, 2017 CIG Sem. D.-J. Dijk

CIG Seminars Spring 2017

Monday 12:15, Génopode, auditorium B, followed by sandwiches

Download the poster

Monday May 8, 2017
Derk-Jan Dijk, University of Surrey, UK
«Circadian regulation of human sleep: a multilevel approach»
Host: Paul Franken

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May 22, 2017 Workshop on « Data management & Open Data »

Workshop on « Data management & Open Data »

 Slide1

The workshop will be accredited by the RESAL as a one day training in animal research.

The number of participants is limited to 200.

This workshop  on « Data management & Open Data » is part of the Lemanic “Open Science & reproducibility” workshop series that aims at sensitizing researchers from UNIL, CHUV, EPFL, UNIGE and HUG to the notion of Open Science in order to improve transparency and reproducibility of their research. This series of events, supported by the FBM Publication & Data Management Unit at CHUV LibraryLemanic Neuroscience Doctoral School and RESAL will be a unique opportunity for scientists to discuss and discover Open Science best practices and standards at all stages of the research process.

During the first part of this workshop, researchers will discover what are the  upcoming policies concerning data management and data sharing of the SNFS funding agency. They will also discover the visions of Prof. F. Bussy (Vice Rector for Research and International Relations, UNIL) and of Prof. P. Vandergheynst (Vice President for education, EPFL) on Open Science. To help you, professionals involved in Big Data management at VitalIT/SIB as well as in Data Management Plan preparation at EPFL/DLCM will teach you best practices in data management and how to collect, describe, store, secure and archive research data.

The second part of the workshop will be dedicated to Open Data. This session will provide researchers with guidance on how to share their data to increase the visibility of their work. You will discover the journal (PloS, Nature Publishing Group) guidelines concerning data sharing. You will learn about data paper (Scientific Data, a  Nature Research Journal) and Zenodo, figshare, two adapted data repositories to meet journal requirements for publishing biomedical research data underlying their publication.

The workshop is free and open to researchers in the biomedical field from UNIL, CHUV, EPFL, UNIGE and HUG at all career stages as well as scientific information/data manager specialists.

Have a look at our preliminary programme

For registration use the link below:
Workshop III – “Data management & Open Data” (May 22, 2017)

Location : Department of Fundamental Neurosciences (DNF), Rue du Bugnon 9, Metro M2 stop “OURS”, Lausanne

You can contact cecile.lebrand@chuv.ch for more information.

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CIG Symposium 2017: Registration is now open!

The Faculty of the CIG is organizing this year again its famous CIG Symposium on the topic:

Innovations in Biology

homepage20173samll circlesHD

Link to the CIG Symposium website

 

Link to the registration online form & sign in afterwards to submit your abstract

Link to reset your password

Link to the programme

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Andrzej Stasiak’s inaugural lecture – April 27, 2017 – Génopode, Aud B, 5pm

Professor Andrzej Stasiak will give an inaugural lecture April 27, 2017 at 5pm in the Génopode’s auditorium B.

Revealing the secrets of chromosome organization by numerical simulations.”

 

Biologiste moléculaire de formation, Andrzej Stasiak est un spécialiste de la structure et de l’organisation des chromosomes durant l’interphase. Chef de groupe au Centre intégratif de génomique depuis 2007, affilié à l’Institut suisse de bioinformatique depuis 2015, il a été promu professeur associé de l’UNIL dès le 1er août 2016.

1953 Naissance à Poznan, Pologne

1977 Master en microbiologie, Institut de microbiologie, Université de Varsovie, Pologne

1981 Thèse sur la structure de l’ADN, Institut de biochimie et de biophysique de l’Académie polonaise des sciences, Varsovie

1981-1989 Post-doctorant, puis assistant de recherche dans le groupe du Prof. Theodor Koller, Institut de biologie cellulaire, Ecole polytechnique fédérale de Zurich

          1989-1990 Chercheur FNS dans le groupe du Prof. Jacques Dubochet, Laboratoire d’analyse ultrastructurale (LAU), UNIL

          1990-1996 Maitre-assistant, LAU, UNIL

          1996-2007 Maitre d’enseignement et de recherche, LAU, UNIL

2007-2016 Maitre d’enseignement et de recherche, Centre intégratif de génomique, UNIL > dès 2015 Affiliation de son groupe au sein de l’Institut suisse de bioinformatique, Lausanne

dès 2016 Professeur associé à la Faculté de biologie et de médecine, UNIL

Pionnier dans l’utilisation de la microscopie électronique pour l’étude de l’ADN et des complexes ADN-protéines, Andrzej Stasiak travaille à l’interface de la biophysique et de la biologie computationnelle. Il s’intéresse tout particulièrement aux aspects topologiques de l’organisation du génome de divers organismes (virus, bactéries, levures ou eucaryotes, dont les humains). Ses recherches s’articulent autour des questions suivantes: quelles sont les conséquences du surenroulement de l’hélice d’ADN sur les processus biologiques clés comme la réplication, la transcription ou la recombinaison des chromosomes? Quels sont les mécanismes physiques et biologiques à l’oeuvre derrière l’organisation des chromosomes? Les travaux d’Andrzej Stasiak ont marqué de nombreux domaines, notamment celui des mathématiques appliquées à la topologie de l’ADN. Ils ont aussi éclairé les mécanismes d’action des topoisomérases, des enzymes qui contrôlent la structure 3D et l’enroulement des molécules d’ADN. La modélisation computationnelle est désormais devenue son approche de recherche privilégiée. Le scientifique et son équipe utilisent des méthodes statistiques provenant de la physique de la matière condensée pour leurs simulations. Ils utilisent également des outils bioinformatiques pour étudier des protéines qui vont former durant leur repliement des noeuds profonds et serrés. En classifiant ces différents noeuds, ils souhaitent comprendre les avantages qu’ils apportent. Le chercheur s’intéresse aussi aux mécanismes d’action de différentes protéines dans le processus de recombinaison et de réparation de l’ADN. Auteur de plusieurs chapitres de livres, le chercheur a également publié un nombre impressionnant d’articles (plus de 200, cités plus de 11’000 fois) dans des revues scientifiques de référence. Ses travaux ont bénéficié du soutien continu du Fonds national suisse depuis 1989, ainsi que des subventions du Human Frontier Science Program, SystemsX et du Leverhulme Trust. Le professeur est par ailleurs très impliqué dans l’enseignement pré- et postgradué où il enseigne trois cours sur la recombinaison de l’ADN, la réparation de l’ADN ainsi que sur la structure et la topologie de l’ADN

 

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