Other events, links, news… Archive


Interviews of the CIG PIs: C.Fankhauser

Series of interviews were written to present each PI of the CIG.
Most of them are already available on the new CIG Report’s website, and every week we will be displaying one of them in the newsletter.

“Let there be light!”

Shade avoidance response in plants

Plants are weird forms of life: they just sit around all day whilst the sun provides their elixir of life: light. Arabidopsis thaliana, for example, has no less than 5 different families of photoreceptors, which capture light with great eagerness. But what happens if the neighbouring oak tree gets too big and casts a dark and gloomy shadow over its surroundings? Believe it or not, the tiny Arabidopsis has seen this coming from the very beginning – a phenomenon termed “neighbor detection” – and has already taken all possible precautions to secure the species’ survival. Prof. Fankhauser and his research team are trying to unravel the mechanisms that control the shade avoidance response in plants: a highly sophisticated machinery, involving hormonal signals and all-encompassing transcriptional events that provoke the appropriate physiological and development responses. Welcome to the world of plants.

“Will you please step out of my sun?”

Diogenes to Alexander the Great (around 330 BC)


Thesis defense of François Mange, Jan. 29, 2018 – 17:30 Aud. C, Génopode



La régulation diurne de l’ARN polymérase III et le rôle de MAF1 dans le foie

François MANGE, Centre lntégratif de Génomique

L’information génétique est contenue dans le génome, qui consiste en une très longue molécule d’acide déoxyribonucléique (ADN). Le génome présent dans le noyau des cellules composant les organismes vivants est nécessaire au développement ainsi qu’au bon fonctionnement de ces derniers. L’expression d’un gène et de sa protéine correspondante se déroule en deux étapes: (1) la chaîne d’ADN sert de matrice pour la polymérisation d’une chaîne d’acide ribonucléique (ARN), (2) la chaîne d’ARN sert ensuite de matrice pour la polymérisation d’une chaîne protéique. Le niveau d’expression d’un gène est régulé par de nombreux complexes protéiques qui vont intervenir soit dans la première étape, nommée transcription, soit dans la deuxième étape, nommée traduction. Les complexes protéiques capable de polymériser de l’ARN se nomment ARN polymérases ADN dépendantes (ARN polymérase). L’ARN a pendant longtemps été considéré comme une molécule intermédiaire, entre ADN et protéines, ces dernières étant les principales effectrices des fonctions cellulaires. Cependant, au fil des décennies, il est devenu évident que l’ARN en tant que tel joue un rôle primordial pour le métabolisme des cellules. Parmi les ARN polymérases, il en est deux qui s’occupent de la synthèse d’ARN ne codant pas pour des protéines, dont celle qui nous intéresse ici se nomme l’ARN polymérase III (Pol III). Les ARN transcrits par la Pol III sont nécessaires à la traduction des autres ARN en protéines. La transcription par la Pol III permet donc d’augmenter les capacités biosynthétiques des cellules (possibilité de produire plus de protéines), elle est donc très étroitement régulée. Parmi ses régulateurs, MAF1 est une phosphoprotéine qui permet d’adapter la transcription de la Pol III en fonction de l’état nutritionnel de la cellule, permettant ainsi de limiter l’activité de la Pol III dans des conditions adverses, comme le manque de nourriture.

Ma thèse a permis d’établir le profil d’activité de la Pol III au cours d’une journée dans le foie d’une souris. J’ai découvert un nouveau mécanisme de régulation de la Pol III qui implique l’horloge circadienne et qui permet l’augmentation de l’activité de la Pol III durant la journée, en préparation de l’apport de nourriture qui surviendra la nuit. Durant ma thèse, je me suis également intéressé à une souris ayant une délétion du gène Maf1. Ces souris ont une activité augmentée de la Pol III et sont protégées contre l’obésité induite par un régime riche en matière grasse. Je me suis donc également intéressé au rôle de MAF1 sur le métabolisme des lipides et j’ai pu mettre en évidence les nombreux gènes et protéines influencés directement ou indirectement par MAF1.


The CIG wishes you happy holidays and happy new year!!



Interviews of the CIG PIs: D. Gatfield

Series of interviews were written to present each PI of the CIG.
Most of them are already available on the CIG Report 2015-2016’s website, and every week we will be displaying one of them in the newsletter.

“Rock around the clock”

The role of translation in circadian rhythms


“I have always wanted to go “all the way”, says Prof. David Gatfield: “doing research from the cellular to the systemic level, deep into the physiology and even the behavior of an animal.” As it turns out, unraveling the machinery behind circadian rhythms offers him the opportunity to live his scientific dream. Indeed, in higher animals most vital processes fluctuate during the day in an orderly fashion: a complex process which is only poorly understood. Prof. Gatfield and his team are trying to understand the fundamental role of RNA and translation – considered far too long a default process in chronobiology – in the control of oscillating biological processes.

♬ Slave to the rhythm ♬
Grace Jones (1985)

Read the complete interview: http://cigreport.genomyx.ch/rock-around-the-clock-the-role-of-translation-in-circadian-rhythms/


Interviews of the CIG PIs : F. Hamaratoglu

Series of interviews were written to present each PI of the CIG.
Most of them are already available on the CIG Report 2015-2016’s website, and every week we will be displaying one of them in the newsletter.

“Size matters!”

Cell-cell signaling in organ size control

Prof. Hamaratoglu and her team are using the wonderful tools of Drosophila genetics in trying to steal from Nature one of its preciously guarded secrets: “How does an organ “know” when to stop growing after reaching a pre-programmed size?” Given the fact that multiple biological processes are involved – cell division and proliferation, differentiation, tissue movements and programmed cell death –, the question as to which regulatory mechanisms are at play and how they are interconnected goes at the heart of understanding the principles that control growth and shape of a biological body.

“You cannot fly like an eagle with the wings of a wren”
William Henry Hudson (1841 – 1922)

Read the complete interview: http://cigreport.genomyx.ch/size-matters-cell-cell-signaling-in-organ-size-control/


CIG’s end of the year celebrations 2017

Thank you to all the participants who gathered yesterday evening to celebrate the end of the year.

A switchdrive document was created to enable you all to upload your pictures and share them with your colleagues: https://drive.switch.ch/index.php/s/XBilhdlW7BrCQtu 


Congratulations again to:

Group Thorens who won the Cocktail contest 2017 – for the second time straight!

Violetta (group DG) who won “the best outfit prize”, and Guy (MEF) who received the selection commitee’s “favorite oufit prize” as well.

Tables “Cetaceans” and “Primates” who won the quiz with both 13 correct responses out of 15 and will share their prize (a cheese selection) during a private aperitif.